急性腎盂腎炎需與急性膀胱炎區(qū)別，前者除有膀胱刺激癥狀外，還有寒戰(zhàn)、高熱和腎區(qū)叩痛。結(jié)核性膀胱炎發(fā)展緩慢，呈慢性膀胱炎癥狀，對藥物治療的反應不佳，尿液中可找到抗酸桿菌，尿路造影顯示患側(cè)腎有結(jié)核病變。膀胱炎與間質(zhì)性膀胱炎的區(qū)別，后者尿液清晰，極少膿細胞，無細菌，膀胱充盈時有劇痛，恥骨上膀胱區(qū)可觸及飽滿而有壓痛的膀胱。嗜酸性膀胱炎的臨床表現(xiàn)與一般膀胱炎相似，區(qū)別在于前者尿中有嗜酸粒細胞，并大量浸潤膀胱粘膜。膀胱炎與腺性膀胱炎的鑒別診斷，主要依靠膀胱鏡檢查和活體組織檢查。
慢性膀胱炎癥狀長期存在且逐漸加重，一般培養(yǎng)無細菌生長，又找不到原發(fā)病時，要考慮腎結(jié)核。腎結(jié)核病人半數(shù)以上有肺與生殖器等腎外結(jié)核病史，血尿多與尿路刺激癥狀同時出現(xiàn)，抗癆治療有效。膀胱炎時，血尿為“終末血尿”，且抗菌治療有效。結(jié)核桿菌培養(yǎng)、尿沉渣找結(jié)核桿菌、腎盂造影及膀胱鏡檢查有助于診斷。有時腎結(jié)核常與普通尿路感染并存。如患者經(jīng)過積極抗菌治療后，仍有尿路刺激癥狀或尿沉渣異常，應高度注意腎結(jié)核存在的可能性，宜作相應檢查。
慢性膀胱炎需與膀胱癌鑒別。
